Llevaba tiempo dandole muchas vueltas a poder hacer una recarga nocturna de los ficheros qlikview con los que estaba trabajando y por fin lo he conseguido, es un proceso tan simple como crear una tarea programada y pasarle un parámetro.
qve.exe [ruta del documento qlikview] documento.qvw /r
ejem: qve.exe c:/documentos/gastos.qvw /r
El parámetro /r abre el documento QlikView, reejecuta el script de carga, salva el documento y lo cierra con los cambios guardados.